Elemento Agua: Explosión de Agua Colisión de Olas. Un Jutsu de tipo Agua
El Elemento Agua (水遁 Suiton) es muy compatible, ya que se puede combinar con los otros 4 elementos. Este se puede utilizar en forma de niebla para ocultar al usuario, o para atrapar a alguien en un Tsunami, su capacidad de alcance es muy alta. Los ataques de Elemento Agua pueden adoptar la forma de armas (Cañon de Agua), misiles (Bala de Agua), animales (Tiburones) o crituras misticas (Dragones). La Naturaleza de chakra tipo Agua, es el Segundo Elemento más común con el que puede nacer una persona y es utilizada principalmente por shinobis de Kirigakure.
El Agua es naturalmente fuerte contra el Fuego, pero del mismo modo, el Agua también es naturalmente débil contra la Tierra. Para utilizar las técnicas de Elemento Agua, es necesario que el usuario este cerca del mar, un río o lago. Aunque hay excepciones, como el miembro de Akatsuki, Kisame Hoshigaki; y Tobirama Senju, el Segundo Hokage, ambos podian hacer Jutsus de Agua, sin necesidad de estar cerca de una fuente de agua, ya que sacaban el Agua del interior de su cuerpo.
Por ejemplo cuando Orochimaru atacó a la Aldea de la Hoja e invocó al Primer Hokage y al Segundo Hokage, hay se pudieron ver las habilidades del Segundo Hokage, ya que el Segundo Hokage hizo el Jutsu Muro de Agua sin necesidad de Agua a su alrededor, la saco de su interior y luego de terminar el jutsu esta se desvanecio, como si nunca hubiera existido.